--SPIDEY version 1.35-- Genomic: lcl|Zv5_scaffold1164 No definition line found, 1276823 bp mRNA: gi|50417081|gb|BC077129.1| Danio rerio zgc:100858, mRNA (cDNA clone MGC:100858 IMAGE:7140330), complete cds MIP, 2905 bp Strand: minus Number of exons: 4 Exon 1(-): 158083-158832 (gen) 1-747 (mRNA) id 98.3% mismatches 13 gaps 3 splice site (d a): 1 0 Exon 2(-): 157812-157976 (gen) 748-912 (mRNA) id 99.4% mismatches 1 gaps 0 splice site (d a): 1 1 Exon 3(-): 156227-156307 (gen) 913-993 (mRNA) id 100.0% mismatches 0 gaps 0 splice site (d a): 1 1 Exon 4(-): 154276-156130 (gen) 994-2846 (mRNA) id 98.5% mismatches 27 gaps 8 splice site (d a): 0 1 Number of splice sites: 3 mRNA coverage: 100% overall percent identity: 98.6% Missing mRNA ends: neither Non-aligning poly(A)+ tail length: 63 Genomic: lcl|Zv5_scaffold1164 No definition line found mRNA: gi|50417081|gb|BC077129.1| Danio rerio zgc:100858, mRNA (cDNA clone MGC:100858 IMAGE:7140330), complete cds MIP Exon 1: 158832-158083 (gen) 1-747 (mRNA) CCTCACGCTTCCCCATCAGAGAGGCTGAATGTCTGCAGGACATGCTCATCACTTGTCAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGGGATCAGAGAGGCTGAATGTCTGCAGGACATGCTCATCACTTGTCAAT CCGTGTTCCTTTATTAAACCTCAGCTAGAACTTCCTCATAGATGCAGAGACCACCAGCCA ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| CCGTGTTCCTTTATTAAACCTCAGCTAGAACGTCCTCATAGATGCAGAGACCACCAGCCA GTTTCAAACTCAAGGTTTTATGACAAAAGCCAACAGGATCGATGATTTCAGTCTTGTGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTTTCAAACTCAAGGTTTTATGACAAAAGCCAACAGGATCGATGATTTCAGTCTTGTGAA GCAGGACTGCCTTTCATGCCAACTTCTTTGTAGCTTGTAGAAGCATTTATGCTTATTTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GCAGGACTGCCTTTCATGCCAACTTCTTTGTAGCTTGTAGAAGCATTTATGCTTATTTTT CCATAGTTCACACACCTTTGTTTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTCTCCATCCGCAAAA ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| CCATAGTTCACACACCTTTGTTTTTTTTT---GTGTGTGTGTGTGTCTCCATCCGCAAAA AAACCAAAGGGATCACATCCAGATCTGCTCATCTTTTTTTGGTGGCTTTCATCCCTCCAT |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| AAACCAAAGGGATCGCATCCAGATCTGCTCATCTTTTTTTGGTGACTTTCATCCCTCCAT TTTCTTCCCTCTGCATTGCTTCTGTTGACTTTTTGCAGCCATGTGGGAGTTCCGGTCCAT |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTTCATCCCTCTGCATTGCTTCTGTTGACTTTTTGCAGCCATGTGGGAGTTCCGGTCCAT M W E F R S M GTCTTTTTGGCGGGCTGTGTTTGCCGAGTTTTACGGCACCATGTTCTTTGTGTTCTTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTCTTTTTGGCGGGCTGTGTTTGCCGAGTTTTACGGCACCATGTTCTTTGTGTTCTTTGG S F W R A V F A E F Y G T M F F V F F G TCTGGGAGCTGCTCTCCGCTGGACCACCGGGCCACACAATGTGCTTCAAGTGGCCTTCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TCTGGGAGCTGCTCTCCGCTGGACCACCGGGCCACACAATGTGCTTCAAGTGGCCTTCTG L G A A L R W T T G P H N V L Q V A F C CTTTGGGCTGGCAGCTGCCACGTTCATCCAATCCATCGGCCACATCAGTGGTGGCCACAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CTTTGGGCTGGCAGCTGCCACGTTCATCCAATCCATCGGCCACATCAGTGGTGGCCACAT F G L A A A T F I Q S I G H I S G G H I CAACCCGGCGGTTACTTTCGCATACCTGATTGGCTCCCAGATGTCCCTGTTTCGTGCCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CAACCCGGCGGTTACTTTCGCATACCTGATTGGCTCCCAGATGTCCCTGTTTCGTGCCTT N P A V T F A Y L I G S Q M S L F R A F CTTCTACATCTGTGCTCAGTGCTTGGGTGCATTGGCTGGCGCCGCTGTGCTTTATGGGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CTTCTACATCTGTGCTCAGTGCTTGGGTGCATTGGCTGGCGCCGCTGTGCTTTATGGGGT F Y I C A Q C L G A L A G A A V L Y G V CACGCCAACCAACATGAGAGGAAATCTTGCCTTGAATACGGTAAGTGGGC |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| CACGCCAACCAATATGAGAGGAAATCTGGCCTTGAATACG T P T N M R G N L A L N T Exon 2: 157976-157812 (gen) 748-912 (mRNA) ATGATTTCAGCTTCAGCCTGGCATCAGTATGGGAATGGCCACTACCATAGAAATATTCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CTTCAGCCTGGCATCAGTATGGGAATGGCCACTACCATAGAAATATTCCT L Q P G I S M G M A T T I E I F L GACCCTGCAGCTTGTGGTTTGTGTGTTCGCTGTGACCGATGAGAGGAGAAACGGGCGACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GACCCTGCAGCTTGTGGTTTGTGTGTTCGCTGTGACCGATGAGAGGAGAAACGGGCGACT T L Q L V V C V F A V T D E R R N G R L GGGGTCTGCTGCCCTGTCCATTGGCTTTTCTGTGCTAGTGGGACACCTGCTGGGGGTAAG ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGGGTCTGCTGCCCTTTCCATTGGCTTTTCTGTGCTAGTGGGACACCTGCTGGGG G S A A L S I G F S V L V G H L L G AGGGC Exon 3: 156307-156227 (gen) 913-993 (mRNA) CTCCTTGCAGATGTATTACACTGGAGCCGGAATGAACCCCGCCAGGTCTTTTGCCCCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATGTATTACACTGGAGCCGGAATGAACCCCGCCAGGTCTTTTGCCCCTGC M Y Y T G A G M N P A R S F A P A TGTGCTCTATAGGAACTTCATTAACCACTGGGTGAGGCAAA ||||||||||||||||||||||||||||||| TGTGCTCTATAGGAACTTCATTAACCACTGG V L Y R N F I N H W Exon 4: 156130-154276 (gen) 994-2846 (mRNA) TTCATGTCAGGTGTATTGGGTGGGCCCTATGATCGGCGCTGCCATGGGAGCTCTGCTCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTGTATTGGGTGGGCCCTATGATCGGCGCTGCCATGGGAGCTCTGCTCTA V Y W V G P M I G A A M G A L L Y CGACTTCATGCTGTTCCCACGCGTGCGGGGTCTGTCCGAGAGACTGGCTGTGCTCAAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CGACTTCATGCTGTTCCCACGCGTGCGGGGTCTGTCCGAGAGACTGGCTGTGCTCAAGGG D F M L F P R V R G L S E R L A V L K G AAACAAACCAACAGAGCCTGAAGCCCAGCAGGAGACGCGAGGAGAGCCAATCGAGCTCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| AAACAAACCAACAGAGCCTGAAGCCCAGCAGGAGACCCGAGGAGAGCCAATCGAGCTCAA N K P T E P E A Q Q E T R G E P I E L K AACACAAGCCTTATAAACACTGCCAGGAAACTGTGGATCCCTAAAGCGACGCATACGTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| AACACAAGCCTTATAAACACTGCCAGGAAACTGTGGATCCCTTAAGCGACGCATACGTAT T Q A L * GATCATTTTACACACACACACACACTTCCAGAGGCAAATCAAGACACCGTAACCCCTTCA ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| GATCATTTTACACACACACACAC--TTCCAGAGGCAAATCAAGACACTGTAACCCCTTCA CAAGGACTATGAATGAGGGTAAGAAGTACCCGCTCAGGGGCACCTCTGTCATTTCTAGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CAAGGACTATGAATGAGGGTAAGAAGTACCCGCTCAGGGGCACCTCTGTCATTTCTAGTC TACTATGAGTGAACTACACTAGAAGTGGACTTCTGCATGCTTTCCGGTTTCACAGGCTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TACTATGAGTGAACTACACTAGAAGTGGACTTCTGCATGCTTTCCGGTTTCACAGGCTTT CAATGATCTCACATTCATTTCACTTTCTTTTTTCCTTTTCTTTGATTTTTCCAGAGACGT |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || CAATGATCTCACATTCATTTCACTTTCTTTTTTC-TTTTCTTTGATTTATCCAGAGATGT GACACGTGTACTACATTATTAGCATTTTGCAACAGATTTCTACTTACTGTCGACATTATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GACACGTGTACTACATTATTAGCATTTTGCAACAGATTTCTACTTACTGTCGACATTATT CAGTTGTGCATGGTGTGTGTGCGTGGGTGTTTTCCGACAGTTTCCAAGTTTGGCTCTTCC ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| CAGTTGTGCATGGTGTGTGTGCGTGTGTGTTTTCCGACAGTTTCCAAGTTTGGCTCTTCC ATTTTCCACAATTCGCTATTTGTTTGTATCAATGCAATGTTCTTTTTTTTT-CTATCTCC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ATTTTCCACAATTCGCTATTTGTTTGTATCAATGCAATGTTCTTTTTTTTTTCTATCTCC CAAAATGAAGGAAACATTCCTTTGATCTTTGGTTTAGGTGGATGTTCATTCACAACTGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CAAAATGAAGGAAACATTCCTTTGATCTTTGGTTTAGGTGGATGTTCATTCACAACTGAA AGCTCTATAAATCCTTTGGGAACTTTGATCCCTCTTCCGAGTCCGTTTCAAACTGTTGTA |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGCTCTATAAATCCTTTGGGAATTTTGATCCCTCTTCCGAGTCCGTTTCAAACTGTTGTA TCGTTTAACGGCAGCCCACAGTGGCCCAAGTATGAAATTCTTTATAAGAAACGCAGTCAC ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TCGTTTACCGGCAGCCCACAGTGGCCCAAGTATGAAATTCTTTATAAGAAACGCAGTCAC ACCATCATTCATTTATCTAAAAAATAAACAAATAAACACACAAAACACAACTAGTCTATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACCATCATTCATTTATCTAAAAAATAAACAAATAAACACACAAAACACAACTAGTCTATT GTTATAGCCCAAATTTCACCTTTATACAGACAGAGCGGGAGGTATTTGTTTACAATAATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTTATAGCCCAAATTTCACCTTTATACAGACAGAGCGGGAGGTATTTGTTTACAATAATA CCGTAAGTGTTGTTTTAACTATGCGTGAGCTGTCACTGACACACTCAGCTCACTTTACGG ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CCGCAAGTGTTGTTTTAACTATGCGTGAGCTGTCACTGACACACTCAGCTCACTTTACGG AAAATACAAACACACGTCTTGTGAGTCCAAAAGCTTTGAGCGCATGTTGAAACCTGTTAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AAAATACAAACACACGTCTTGTGAGTCCAAAAGCTTTGAGCGCATGTTGAAACCTGTTAG TTACAGACACAACTTAAGAAAGCAGAAGATATCTCTGAATGGGTTGTTGTTTTCTTACAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTACAGACACAACTTAAGAAAGCAGAAGATATCTCTGAATGGGTTGTTGTTTTCTTACAT GTATAATATATGATACTGTAAAGCACACAATATCACATAAGCAAGAGTGCCATTTTCCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTATAATATATGATACTGTAAAGCACACAATATCACATAAGCAAGAGTGCCATTTTCCAT ACAAAATAGATTTTTATATTGGGTTAGCTACTGTACATTTTAGAGACCATATAGTGTTTT |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ACAATATAGATTTTTATATTGGGTTAGCTACTGTACATTTTAGAGACCATATAGTGTT-T TTTCCGTTTCACGCAAGAAGCCAGAGATTTGTGCATCTCAGAGTAAAACCGCTGTGTTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTTCCGTTTCACGCAAGAAGCCAGAGATTTGTGCATCTCAGAGTAAAACCGCTGTGTTTT GTTCCTGAATGAATCTTATTTTTGAACAAATGGAATGAGGAAATGATTCAATAATCCATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTTCCTGAATGAATCTTATTTTTGAACAAATGGAATGAGGAAATGATTCAATAATCCATT TGCATGACTTGTTTCCTTTCTAAATGAATCTGCAGTTTTGAATGAATCAATTAAATAAAC ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| TGCATCACTTGTTTCCTTTCTAAATGAATCTGCAGTTTTGAATGAATCAATTGAATAAAA GATTCAGTGAACTTTTTGTCAACTTCACACTCCCCAAACAAGAAGTTTTTACCCTCAGTA |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GATTCAGTGAACTTTTTGTCAATTTCACACTCCCCAAACAAGAAGTTTTTACCCTCAGTA GAGTTTAGTACTTTTAAAAATATTCCAAAGTACATTGTTGTTTTCTCAGACTTATTTTTT ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAGTTTAGTAC-TTTAAAAATATTCCAAAGTACATTGTTGTTTTCTCAGACTTATTTTTT TCGTCTGCATTTTCTGTGTAGATTAGCAGGTTTGGCATCATTTTGTGTGTAAATAGCTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TCGTCTGCATTTTCTGTGTAGATTAGCAGGTTTGGCATCATTTTGTGTGTAAATAGCTTA AGTTGTGTTCTGACATTTAGTCTCAGGCAAATGAACATTTCTGTAAATCACTGTAAAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| AGTTGTGTTCTGACATTTAGTCTCAGGCAAATGAACATTTCTGTAATTCACTGTAAAAGA AATATGAAGCCTTACTGATGTGAGCAGAACAGGTTTAAAACATCATGGACTTATTAGTGA |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| AATATGAAGCCTTACTGATGTGAGCAGAACAGATTTAAAACATCATGGACTTATTAGTGA CTGTTTCTG--TTTTTTACAGTAGACTGGTACAGGGATTATGTCAAGACCTGAAAGAATT ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CTGTTCCTGTTTTTTTTACATTAGACTGGTACAGGGATTATGTCAAGACCTGAAAGAATT CTTCACTGTGGATTTTCCCATGGAATATTTCAATTTACGAGTAAAATAAAGACTGTGCTA ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CTTTACTGTGGATTTTCCCATGGAATATTTCAATTTACGAGTAAAATAAAGACTGTGCTA ATGTAAAATGCTTTCATG |||||||| ATGTAAAA