--SPIDEY version 1.35-- Genomic: lcl|AL935305.13 CH211-226I4 (2004-01-16 01:22:12), 190222 bp mRNA: gi|68533563|gb|BC098535.1| Danio rerio zgc:110015, mRNA (cDNA clone MGC:110015 IMAGE:7275955), complete cds, 2175 bp Strand: minus Number of exons: 4 Exon 1(-): 170950-171769 (gen) 1-822 (mRNA) id 99.6% mismatches 3 gaps 2 splice site (d a): 1 0 Exon 2(-): 170605-170769 (gen) 823-987 (mRNA) id 100.0% mismatches 0 gaps 0 splice site (d a): 1 1 Exon 3(-): 170411-170491 (gen) 988-1068 (mRNA) id 100.0% mismatches 0 gaps 0 splice site (d a): 1 1 Exon 4(-): 168079-169158 (gen) 1069-2147 (mRNA) id 99.9% mismatches 1 gaps 1 splice site (d a): 0 1 Number of splice sites: 3 mRNA coverage: 100% overall percent identity: 99.8% Missing mRNA ends: neither Non-aligning poly(A)+ tail length: 31 Genomic: lcl|AL935305.13 CH211-226I4 (2004-01-16 01:22:12) mRNA: gi|68533563|gb|BC098535.1| Danio rerio zgc:110015, mRNA (cDNA clone MGC:110015 IMAGE:7275955), complete cds Exon 1: 171769-170950 (gen) 1-822 (mRNA) TTTGTGGTCTGTCAGACCAGCTCTACTTGGTGTGGGCAGGATATGCTCTGTAACCTCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTCAGACCAGCTCTACTTGGTGTGGGCAGGATATGCTCTGTAACCTCTTC TGTGTCGCTCAACTAGAATTAGCCCTATAGATTTAGCTTGTAGCATCGATGTTCAGGTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGTGTCGCTCAACTAGAATTAGCCCTATAGATTTAGCTTGTAGCATCGATGTTCAGGTCT CTCTGACAAAACCCTCCAGATTTTCTACGCATGCACACACACACACACAACCACACACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CTCTGACAAAACCCTCCAGATTTTCTACGCATGCACACACACACACACAACCACACACAC CTCATGTTTCTTTAGCAGTCCGGGTGTTGTGCAGGCGAAGAGAAACAGCGCTGGCAGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CTCATGTTTCTTTAGCAGTCCGGGTGTTGTGCAGGCGAAGAGAAACAGCGCTGGCAGAGA AGACCCGTGTGCGGCTACATGTGTGACCATTTACTCACGGCTTCCCACACAGCCTTAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGACCCGTGTGCGGCTACATGTGTGACCATTTACTCACGGCTTCCCACACAGCCTTAGCT AACGGCTAGATCTATTAGGCCTAATTATTGATCTGTTTTTGAGGAACTTTTAGTGTACTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AACGGCTAGATCTATTAGGCCTAATTATTGATCTGTTTTTGAGGAACTTTTAGTGTACTT GGCAAAAAAAAAA--GGACATTATATTTTTTTTAAAGACATTTTTCTTGCCAACTCGAAA ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGCAAAAAAAAAAAAGGACATTATATTTTTTTTAAAGACATTTTTCTTGCCAACTCGAAA AAACAAACAAAAAAGTTTCGGTTTTGAATTTAGTTGGGACTCATAAATCATAATGTGGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AAACAAACAAAAAAGTTTCGGTTTTGAATTTAGTTGGGACTCATAAATCATAATGTGGGA M W E GTTTCGCTCTATGATGTTTTGGCGGGCGGTGTTTGCCGAGTTTTTCGGCACCATGTTCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| GTTTCGCTCTATGATGTTTTGGCGGGCGGTGTTTGCCGAGTTTTTCAGCACCATGTTCTT F R S M M F W R A V F A E F F S T M F F CGTGTTCTTCGGGATGGGTGCCGCTCTACGCTGGACCACCGGGCCGTACCATGTCTTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CGTGTTCTTCGGGATGGGTGCCGCTCTACGCTGGACCACCGGGCCGTACCATGTCTTCCA V F F G M G A A L R W T T G P Y H V F H CACTGCTCTCTGCTTTGGTTTTGCTGCTGCCACACTCATTCAATCCATCGGCCACATCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CACTGCTCTCTGCTTTGGTTTTGCTGCTGCCACACTCATTCAATCCATCGGCCACATCAG T A L C F G F A A A T L I Q S I G H I S CGGAGGACACATTAATCCGGCTGTCACCTTTGCATACTTAGTCGGCTCTCAGATGTCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CGGAGGACACATTAATCCGGCTGTCACCTTTGCATACTTAGTCGGCTCTCAGATGTCTGT G G H I N P A V T F A Y L V G S Q M S V GTTCAGAGCTTTCTTCTACATTTGTGCTCAGTGTCTGGGGGCCATGGCAGGAGCCGCGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTTCAGAGCTTTCTTCTACATTTGTGCTCAGTGTCTGGGGGCCATGGCAGGAGCCGCGGC F R A F F Y I C A Q C L G A M A G A A A GCTCTACGGAGTTACACCCAACAACATGAGGGGCACGATGGCACTTAACACGGTAAGAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GCTCTACGGAGTTACACCCAACAACATGAGGGGCACGATGGCACTTAACACG L Y G V T P N N M R G T M A L N T GT Exon 2: 170769-170605 (gen) 823-987 (mRNA) TTCTCTCCAGCTTCAGCCTGGCATGAGTCTGGGAATGGCCACCACAGTGGAGGTGTTCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CTTCAGCCTGGCATGAGTCTGGGAATGGCCACCACAGTGGAGGTGTTCCT L Q P G M S L G M A T T V E V F L CACTATGCAGTTGGTGGTCTGCGTTTTCGCTGTCACTGATGAAAGAAGAAATGGACGTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CACTATGCAGTTGGTGGTCTGCGTTTTCGCTGTCACTGATGAAAGAAGAAATGGACGTCT T M Q L V V C V F A V T D E R R N G R L GGGTTCTGCTGCTCTGTCCATTGGATTCTCTGTTACTATGGGCCACCTGATGGGGGTGAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGGTTCTGCTGCTCTGTCCATTGGATTCTCTGTTACTATGGGCCACCTGATGGGG G S A A L S I G F S V T M G H L M G AAACA Exon 3: 170491-170411 (gen) 988-1068 (mRNA) TTTCAACCAGATGTACTACACTGGAGCTGGAATGAACCCAGCCAGGTCTTTCGCCCCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATGTACTACACTGGAGCTGGAATGAACCCAGCCAGGTCTTTCGCCCCTGC M Y Y T G A G M N P A R S F A P A TGTTATCACCAGGAATTTCATCAACCACTGGGTAAGAAAAA ||||||||||||||||||||||||||||||| TGTTATCACCAGGAATTTCATCAACCACTGG V I T R N F I N H W Exon 4: 169158-168079 (gen) 1069-2147 (mRNA) GGTGTGATAGGTGTACTGGGTGGGTCCGATGATTGGTGCTGCTATGGGTGCCATCTTCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTGTACTGGGTGGGTCCGATGATTGGTGCTGCTATGGGTGCCATCTTCTA V Y W V G P M I G A A M G A I F Y TGACTTCTTCCTGTTCCCCCGTATGCGGGGCTTCTCTGAGCGGCTAGCCACGCTGAAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGACTTCTTCCTGTTCCCCCGTATGCGGGGCTTCTCTGAGCGGCTAGCCACGCTGAAGGG D F F L F P R M R G F S E R L A T L K G CAGTCGACCCCCAGAGGCCGAGAACCAGCAGGAGACCCGCGGGGAGCCCATCGAGCTCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CAGTCGACCCCCAGAGGCCGAGAACCAGCAGGAGACCCGCGGGGAGCCCATCGAGCTCAA S R P P E A E N Q Q E T R G E P I E L K GACTCAAACCCTATAAACCTGCAGAGAAGTTGTGGACCGAATCTGGCTCTACCTCACTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GACTCAAACCCTATAAACCTGCAGAGAAGTTGTGGACCGAATCTGGCTCTACCTCACTGG T Q T L * ACCATCTCACTGCCCTGAGCAGCCAATAAACCTCCTGCGACGCAACACCAGAGACCCGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACCATCTCACTGCCCTGAGCAGCCAATAAACCTCCTGCGACGCAACACCAGAGACCCGCA GAGGGTCGCATTTACACGGCAAGATCAGTAAGGGAGCAGAAATGAGTACATTACTCCGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAGGGTCGCATTTACACGGCAAGATCAGTAAGGGAGCAGAAATGAGTACATTACTCCGGG TAGTATTCTAGGTTTGCTGCTAGTACCAGTGCAGGGTAGAGGGCGGTTCTGAGGTGGGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TAGTATTCTAGGTTTGCTGCTAGTACCAGTGCAGGGTAGAGGGCGGTTCTGAGGTGGGGT TGTGGGCGGGGCTTATGTTGTGGGAGGGGCTGTAGCAATTTATTTAGGCATGCTTTTCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGTGGGCGGGGCTTATGTTGTGGGAGGGGCTGTAGCAATTTATTTAGGCATGCTTTTCAC TTTTCATCTGACTTCATTTTCACAATTCATTTTCAATTTTTCGTTTTCTACAAACAACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTTTCATCTGACTTCATTTTCACAATTCATTTTCAATTTTTCGTTTTCTACAAACAACAA GATGTGGATGTACGCAACTTAACCAGGGTTTCACACTTTTTATTTTCTGTGAGAGTTCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GATGTGGATGTACGCAACTTAACCAGGGTTTCACACTTTTTATTTTCTGTGAGAGTTCAA GTGAGTGCAGCTTTGTGGGTCTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTGAGTGCAGCTTTGTGGGTCTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGG GAGAGCGTGCCAAGGTATGTTTGTGTGTTTCGCTTGTGCACGACCAAGTGTACTGTATGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAGAGCGTGCCAAGGTATGTTTGTGTGTTTCGCTTGTGCACGACCAAGTGTACTGTATGT GTGTGTGTGTGTGAGTGAGTGAGTGTGTCTGTCATCTGAGCATTTCTTTTGGGTTTTTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTGTGTGTGTGTGAGTGAGTGAGTGTGTCTGTCATCTGAGCATTTCTTTTGGGTTTTTAT CATTACAGCTCGCTCGTGTTTGTACCATGCTTGTTTTTTTTTTTCCCTTTCTTATTTTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| CATTACAGCTCGCTCGTGTTTGTACCATGCTTGTTTTT-TTTTTCCCTTTCTTATTTTTA CGGGACTCTAAAACACCCCAAACTGTATTGTTTGCTATGATCTTCCATTCACTTTTCATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CGGGACTCTAAAACACCCCAAACTGTATTGTTTGCTATGATCTTCCATTCACTTTTCATT CACACAAACCACCCATGGACTGAGCTGTTTTAAACACAGCCAGTCCTTGCCACCAGTCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CACACAAACCACCCATGGACTGAGCTGTTTTAAACACAGCCAGTCCTTGCCACCAGTCTT TACAATTACTTCTCGAGTTTACAGTGTCTGTGTTGCCTTTCATAAAATCTTGTTTGAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TACAATTACTTCTCGAGTTTACAGTGTCTGTGTTGCCTTTCATAAAATCTTGTTTGAGGA TAACATCCATGACTGGGCAAGTAAAGCAATATGAATCATATCTGAATGCAAATAAATACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TAACATCCATGACTGGGCAAGTAAAGCAATATGAATCATATCTGAATGCAAATAAATACA TGAAAAGAAACGGCTCGGTG |||||||||| TGAAAAGAAA