--SPIDEY version 1.35-- Genomic: lcl|zK245N4 No definition line found, 117265 bp mRNA: gi|28422290|gb|BC044188.1| Danio rerio aquaporin 3, mRNA (cDNA clone MGC:55525 IMAGE:2642034), complete cds, 1824 bp Strand: minus Number of exons: 6 Exon 1(-): 74203-74381 (gen) 1-179 (mRNA) id 100.0% mismatches 0 gaps 0 splice site (d a): 1 0 Exon 2(-): 71789-71915 (gen) 180-306 (mRNA) id 100.0% mismatches 0 gaps 0 splice site (d a): 1 1 Exon 3(-): 71520-71657 (gen) 307-444 (mRNA) id 100.0% mismatches 0 gaps 0 splice site (d a): 1 1 Exon 4(-): 71273-71397 (gen) 445-569 (mRNA) id 99.2% mismatches 1 gaps 0 splice site (d a): 1 1 Exon 5(-): 70571-70788 (gen) 570-787 (mRNA) id 100.0% mismatches 0 gaps 0 splice site (d a): 1 1 Exon 6(-): 68989-70007 (gen) 788-1806 (mRNA) id 100.0% mismatches 0 gaps 0 splice site (d a): 0 1 Number of splice sites: 5 mRNA coverage: 99% overall percent identity: 99.9% Missing mRNA ends: right Non-aligning poly(A)+ tail length: 18 Genomic: lcl|zK245N4 No definition line found mRNA: gi|28422290|gb|BC044188.1| Danio rerio aquaporin 3, mRNA (cDNA clone MGC:55525 IMAGE:2642034), complete cds Exon 1: 74381-74203 (gen) 1-179 (mRNA) ACTTCATGTGAGCACACGTCTCTGAGGAACATACAGCTTGTTTCATCCAGACAAAGGAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGCACACGTCTCTGAGGAACATACAGCTTGTTTCATCCAGACAAAGGAAA ACATCTGGACAAGTCTGAAAGATGGGTTGGCAGAAAAGCGTTCTGGATAAGCTTGCGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACATCTGGACAAGTCTGAAAGATGGGTTGGCAGAAAAGCGTTCTGGATAAGCTTGCGCAG M G W Q K S V L D K L A Q ACTTTCCAAATCCGCAACAAGTTACTGCGCCAGGGATTGGCTGAATGCTTAGGAACTCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACTTTCCAAATCCGCAACAAGTTACTGCGCCAGGGATTGGCTGAATGCTTAGGAACTCTC T F Q I R N K L L R Q G L A E C L G T L ATCCTGGTGGTGGGTATTT ||||||||| ATCCTGGTG I L V Exon 2: 71915-71789 (gen) 180-306 (mRNA) TATTTCACAGATGTTTGGCTGTGGTTCATTGGCCCAGTTGAAACTAAGCGAAGGTTCTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATGTTTGGCTGTGGTTCATTGGCCCAGTTGAAACTAAGCGAAGGTTCTCA M F G C G S L A Q L K L S E G S H TGGTCTCTTTCTCACTGCAAACCTTGCTTTTGGGTTTGGTGCTACTCTTGGAATCTTGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGGTCTCTTTCTCACTGCAAACCTTGCTTTTGGGTTTGGTGCTACTCTTGGAATCTTGGT G L F L T A N L A F G F G A T L G I L V TTGCGGCCAGGTGTCAGGTAGGCAAAC ||||||||||||||||| TTGCGGCCAGGTGTCAG C G Q V S Exon 3: 71657-71520 (gen) 307-444 (mRNA) TCATCTTTAGGCGGACATTTAAATCCTGCTGTTACATTTGCTCTCTGCCTCTTGGGAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GCGGACATTTAAATCCTGCTGTTACATTTGCTCTCTGCCTCTTGGGAAGA G G H L N P A V T F A L C L L G R GAAAAATGGAGAAAGTTTCCTGTGTACTTTCTGTTCCAAACACTCGGATCCTTCTTGGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAAAAATGGAGAAAGTTTCCTGTGTACTTTCTGTTCCAAACACTCGGATCCTTCTTGGGT E K W R K F P V Y F L F Q T L G S F L G GCTGCTATTATCTTTGCCGAATACCATGGTAAATGTTT |||||||||||||||||||||||||||| GCTGCTATTATCTTTGCCGAATACCATG A A I I F A E Y H Exon 4: 71397-71273 (gen) 445-569 (mRNA) TGTATTTTAGACGCAATTTATGATTATGCTGGAGAATCAAATGAGTTGCTTGTACTGGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ACGCAATTTATGATTATGCTGGAGAATCAAATGAATTGCTTGTACTGGGT D A I Y D Y A G E S N E L L V L G GAAAAAGAAACAGCTGGGATTTTTGCTACATACCCAAGCAAATATCTCACCCCCCTAAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAAAAAGAAACAGCTGGGATTTTTGCTACATACCCAAGCAAATATCTCACCCCCCTAAAT E K E T A G I F A T Y P S K Y L T P L N GGATTTTTTGACCAGGTCAGTAAAT ||||||||||||||| GGATTTTTTGACCAG G F F D Q Exon 5: 70788-70571 (gen) 570-787 (mRNA) ATCTTGACAGGTGATAGGCACAGCATCCCTGATTGTGTGCATCCTGGCCATTGTGGACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTGATAGGCACAGCATCCCTGATTGTGTGCATCCTGGCCATTGTGGACCC V I G T A S L I V C I L A I V D P CTACAACAACCCGATCCCTCAAGGTCTTGAGGCCTTCACAGTGGGATTCAGCGTCCTTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CTACAACAACCCGATCCCTCAAGGTCTTGAGGCCTTCACAGTGGGATTCAGCGTCCTTAT Y N N P I P Q G L E A F T V G F S V L I CATTGGTCTCTCCATGGGCTTCAATTCTGGCTATGCAGTAAACCCAGCTCGAGATTTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CATTGGTCTCTCCATGGGCTTCAATTCTGGCTATGCAGTAAACCCAGCTCGAGATTTTGG I G L S M G F N S G Y A V N P A R D F G ACCTCGTCTTTTTACTGCCATGGCTGGTTGGGGTAGTGAAGTCTTCACGTAAGTGGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACCTCGTCTTTTTACTGCCATGGCTGGTTGGGGTAGTGAAGTCTTCAC P R L F T A M A G W G S E V F T Exon 6: 70007-68989 (gen) 788-1806 (mRNA) TTTGCAACAGAGCCAGGGATTATTGGTTTTTGGTGCCCATCTTTGCTCCGTTCATTGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGCCAGGGATTATTGGTTTTTGGTGCCCATCTTTGCTCCGTTCATTGGAG A R D Y W F L V P I F A P F I G CCGTTATTGGTGTGATTGTGTACCAGCTGATGGTGGGATGGCATGTGGAAGGAGAGGCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CCGTTATTGGTGTGATTGTGTACCAGCTGATGGTGGGATGGCATGTGGAAGGAGAGGCAC A V I G V I V Y Q L M V G W H V E G E A GAGATAAGAAAGCTAAAGCTAGAGAGGAGGTGATGAACCTCAATGACGTCGCCAGCAAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAGATAAGAAAGCTAAAGCTAGAGAGGAGGTGATGAACCTCAATGACGTCGCCAGCAAGG R D K K A K A R E E V M N L N D V A S K AATGATTTTCAGGATCTCCATCAGCCCTCAACACCACAAATCCACATAAGCTTCTGCTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AATGATTTTCAGGATCTCCATCAGCCCTCAACACCACAAATCCACATAAGCTTCTGCTTA E * AGGATCTCTGGGTTCAATAAAAACCACTTGCACCACACAAAACTCCCTCATCTGTTTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGGATCTCTGGGTTCAATAAAAACCACTTGCACCACACAAAACTCCCTCATCTGTTTCAG AGGTGATTCTCACAGTTTTGCAGATCTTCCACTGGACTTTGAATAAAAAGCGTTATACAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGGTGATTCTCACAGTTTTGCAGATCTTCCACTGGACTTTGAATAAAAAGCGTTATACAT TTCTATACTTTACAAATTCTGGGTTGTTTTAACCAAATTTGGGTACAATTTTGACTAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTCTATACTTTACAAATTCTGGGTTGTTTTAACCAAATTTGGGTACAATTTTGACTAACC CAATGGTTGGCTTAAAAATTTTATTTAAAAATTTAACCAACTGCTGGGTTATTGCTTTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CAATGGTTGGCTTAAAAATTTTATTTAAAAATTTAACCAACTGCTGGGTTATTGCTTTCC AACCCAGCATTATTTTAGATTTCCAACTTTATATCAGACATTTGATTGTTTTTCAAGCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AACCCAGCATTATTTTAGATTTCCAACTTTATATCAGACATTTGATTGTTTTTCAAGCAT GACTCTTATTTCTTTCTTCCACATGCTTTATTCTTCCATTAAGGGAACAAGGTGTTACTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GACTCTTATTTCTTTCTTCCACATGCTTTATTCTTCCATTAAGGGAACAAGGTGTTACTT CAACAGGACGAATTATATTAATTCACTCTTTTGAAAAGTTAGTAAAAGTTTAGATCTTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CAACAGGACGAATTATATTAATTCACTCTTTTGAAAAGTTAGTAAAAGTTTAGATCTTTG AAATGAAACTGTTGTTGTTACACCTATCAATATATACAGTATTTCATGCTTTTGTGCTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AAATGAAACTGTTGTTGTTACACCTATCAATATATACAGTATTTCATGCTTTTGTGCTAC TAATATCTAAATATGTTGCCATTCACGCTGAGAAAGTTGAGAAGTTACCCAAAAAAGCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TAATATCTAAATATGTTGCCATTCACGCTGAGAAAGTTGAGAAGTTACCCAAAAAAGCTA CAGTACTTTTTAAAAAAATTGTAAATATTTTGTATTGTCATTTTCATTTAAAGCATTTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CAGTACTTTTTAAAAAAATTGTAAATATTTTGTATTGTCATTTTCATTTAAAGCATTTTT TTTTGTTGTATTACATGTATGGATTACAACTTAACATGTACACTTACGTCTGATAGTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTTTGTTGTATTACATGTATGGATTACAACTTAACATGTACACTTACGTCTGATAGTGGA GAGATCCTGACATTTATTTGACATTGCAGTTTTTAGACTGTTAGATCTGTTCATTTCATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAGATCCTGACATTTATTTGACATTGCAGTTTTTAGACTGTTAGATCTGTTCATTTCATA ACATGTTAATTTTGAAAGTGAATGTTTTAAATCAACTGATTGTTATCCTAATAAATTTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACATGTTAATTTTGAAAGTGAATGTTTTAAATCAACTGATTGTTATCCTAATAAATTTTT TTAAAGAAGTCTCACATGT ||||||||| TTAAAGAAG