--SPIDEY version 1.35-- Genomic: lcl|Zv5_scaffold821 No definition line found, 1510981 bp mRNA: gi|49904370|gb|BC075911.1| Danio rerio zgc:92167, mRNA (cDNA clone MGC:92167 IMAGE:7050456), complete cds, 1462 bp Strand: minus Number of exons: 6 Exon 1(-): 1260246-1260406 (gen) 1-161 (mRNA) id 99.4% mismatches 1 gaps 0 splice site (d a): 1 0 Exon 2(-): 1257078-1257204 (gen) 162-288 (mRNA) id 100.0% mismatches 0 gaps 0 splice site (d a): 1 1 Exon 3(-): 1256146-1256283 (gen) 289-426 (mRNA) id 100.0% mismatches 0 gaps 0 splice site (d a): 1 1 Exon 4(-): 1254250-1254368 (gen) 427-545 (mRNA) id 98.3% mismatches 2 gaps 0 splice site (d a): 1 1 Exon 5(-): 1253789-1254006 (gen) 546-763 (mRNA) id 100.0% mismatches 0 gaps 0 splice site (d a): 1 1 Exon 6(-): 1252833-1253500 (gen) 764-1434 (mRNA) id 95.7% mismatches 29 gaps 7 splice site (d a): 0 1 Number of splice sites: 5 mRNA coverage: 99% overall percent identity: 97.8% Missing mRNA ends: right Non-aligning poly(A)+ tail length: 27 Genomic: lcl|Zv5_scaffold821 No definition line found mRNA: gi|49904370|gb|BC075911.1| Danio rerio zgc:92167, mRNA (cDNA clone MGC:92167 IMAGE:7050456), complete cds Exon 1: 1260406-1260246 (gen) 1-161 (mRNA) ACAGACTGAGGTCAGACCATCTCTAAACAACAGTACAGTAGCAAGTTGAGCTCTGCCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTCAGACCATCTCTAAACAACAGTACAGTAGCAAGTTGAGCTCTGCCTGC AAGTAAATATTAAAAATGAGTCAGATGAAGAAGATCATGAAGAGGATGAAGGTGAAAAAT |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AAGTAATTATTAAAAATGAGTCAGATGAAGAAGATCATGAAGAGGATGAAGGTGAAAAAT M K R M K V K N GAACTGGCACGACAGATTATGGGAGAGATCTTGGGCACTTTTGTTCTTCTGGTGAGTTTT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAACTGGCACGACAGATTATGGGAGAGATCTTGGGCACTTTTGTTCTTCTG E L A R Q I M G E I L G T F V L L T Exon 2: 1257204-1257078 (gen) 162-288 (mRNA) TCTGCTCCAGTTGTTTGGTTGTGCTGCAGCGGCTCAGGTGAAAACCAGCAGAGAAACAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTGTTTGGTTGTGCTGCAGCGGCTCAGGTGAAAACCAGCAGAGAAACAAA L F G C A A A A Q V K T S R E T K GGGGCAGTTTCTGTCTGGTAACATCGCCTTCTCTGTAGGTGTCATGTCTGCCATGTACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGGGCAGTTTCTGTCTGGTAACATCGCCTTCTCTGTAGGTGTCATGTCTGCCATGTACCT G Q F L S G N I A F S V G V M S A M Y L CTGCAGGGCAGTATCAGGTAAAATTGT ||||||||||||||||| CTGCAGGGCAGTATCAG C R A V S Exon 3: 1256283-1256146 (gen) 289-426 (mRNA) TCTCCCTCAGGAGCTCATCTAAACCCAGCTGTGTCTCTGAGTTTCTGTGTATTGGGAGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAGCTCATCTAAACCCAGCTGTGTCTCTGAGTTTCTGTGTATTGGGAGAC G A H L N P A V S L S F C V L G D CTGGCCTGGATAAAGCTGCTACCATATTCTCTCGCTCAAATTTTAGGGGCTTACCTTGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CTGGCCTGGATAAAGCTGCTACCATATTCTCTCGCTCAAATTTTAGGGGCTTACCTTGCT L A W I K L L P Y S L A Q I L G A Y L A TCAGGGCTTGTCTATCTCATCTACCATGGTAAGAAGAT |||||||||||||||||||||||||||| TCAGGGCTTGTCTATCTCATCTACCATG S G L V Y L I Y H Exon 4: 1254368-1254250 (gen) 427-545 (mRNA) TCTCCTCCAGATGCCATCATGGAGTTCAGTGGTGGAGTTCTGACCGTATTTGGCCCTAAT ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATGCCATCATGGAATTCAGTGGTGGAGTTCTGACCGTATTTGGCCCTAAT D A I M E F S G G V L T V F G P N GAAACAGCCAGTATCTTCGCCACTTACCCAACCGATGTAGTATCAGTGCAGACCAATTTC |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| GAAACAGCCAGTATCTTCGCCACTTACCCAACTGATGTAGTATCAGTGCAGACCAATTTC E T A S I F A T Y P T D V V S V Q T N F CTGGATCAGGTTAGCAGAA ||||||||| CTGGATCAG L D Q Exon 5: 1254006-1253789 (gen) 546-763 (mRNA) CTGTGTGCAGGTGGTTGGCACAGCCATGCTGATGCTGTGCATTTTGCCTTTGAATGATAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTGGTTGGCACAGCCATGCTGATGCTGTGCATTTTGCCTTTGAATGATAA V V G T A M L M L C I L P L N D K GAGAAACGCCCCAGCTCCTGAAGCGCTGCTCCCGCCCATTGTAGCAACTGTTGTTCTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAGAAACGCCCCAGCTCCTGAAGCGCTGCTCCCGCCCATTGTAGCAACTGTTGTTCTTGG R N A P A P E A L L P P I V A T V V L G GATTTCCATCTCAATGTCGGCTAATTGTGGAGCAGCCATAAATCCAGCACGTGATCTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GATTTCCATCTCAATGTCGGCTAATTGTGGAGCAGCCATAAATCCAGCACGTGATCTTGG I S I S M S A N C G A A I N P A R D L G TCCACGACTCTTCACCTTTACAGCAGGCTGGGGCACTGAAGTCTTTACGTATGTAATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TCCACGACTCTTCACCTTTACAGCAGGCTGGGGCACTGAAGTCTTTAC P R L F T F T A G W G T E V F T Exon 6: 1253500-1252833 (gen) 764-1434 (mRNA) TTCATTACAGGTGCTATGACTACTTCTTTTGGATCCCATTGGTGGCTCCTATGGTAGGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTGCTATGACTACTTCTTTTGGATCCCATTGGTGGCTCCTATGGTAGGGG C Y D Y F F W I P L V A P M V G GTGTCCTGGGCTCCATCATTTATTTGGTTTTCATCCAGTGGCATCTGCCTGAGCTTGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTGTCCTGGGCTCCATCATTTATTTGGTTTTCATCCAGTGGCATCTGCCTGAGCTTGAAG G V L G S I I Y L V F I Q W H L P E L E ATGAATCTGAATCTGAGGAGATGAATGATCAAACAAAAGTCATGGAGCACAACAACAAAA ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATGAATCTGAATCTGGGGAGATGAATGATCAAACAAAAGTCATGGAGCACAACAACAAAA D E S E S G E M N D Q T K V M E H N N K AAGATGAGATATACCTTAAAATGTCTTCAATTTAAAAAGTCTGGAAAATATTGAATTTTC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| AAGATGAGATATACCTTAAAATGTCTTCAATTTAAAAAGTCTGGAAAATGTTTAATTTTC K D E I Y L K M S S I * CTTACACATTTCCAGATTTATTTCCCTGCGTTTACCCATTATTCCTGGACTGCTTTATAC || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| CTAACACATTTCCAGATTTATTTCCCCGCGTTTACCCATTATTCCTGGACTGCTTTATAC TGTAAATATTTAAAAAATGTGGAAAGGCCACAACAT--AAGAATAGGGAAATGTACTCAA ||||| || || ||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| TGTAA--ATGTAGAAAATAGGGAAAGGCCACAACATAAAAAAATGGGGAAATGTACTCAA GATGGACTTTAAAAGCTTTTTCAACAGATGGAAAAACTTTACATATTATTTATTACCATT |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| GATGGACTTTAAAAGCTTTTACAGCAGATGGAAAAACTTTACACATTATTTATTACCATT TCTGTCTCTTTCTTTCCCTTTTAAGACTGGGACATTATTTTATATTTAAAAAAAACCTTC ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| TCTGTCTCTTTCTTTCCCTTTTAAGACTGGGACTTTATTTTATATTTAAAAAAAACCTTT ACATTGTCCACTATTTCTTGACTGTGAATATATTTTTTTGTATATAGTATGTACAGTATA |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACATTGTCCACTATTTCTCAACTGTGAATATATTTTTTTGTATATAGTATGTACAGTATT TTAGCTA-TTTTAATGTGACTCTTATTGTACTGGTGGTAGCCAGACATTTAGTTCTTA-- ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTAGCTATTTTTAATATGACTCTTATTGTACTGGTGGTAGCCAGACATTTAGTTCTTACC CACACACACATACACAATTTAGATCCCCGTTTATTATAACATTAGAAAGATTTAATATCA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| CACACACACATACACAATTTAGATCCCCGTTTATTATAATATTAGAAAGATTTAATATCA CCACAATAAATGCTTATATTTGTATGTTGTCTC |||||||||||||| |||||||| CCACAATAAATGCTCATATTTGT